Чексинский находится примерно в 40 км от Междуреченска в горно-таёжной местности. Границы участка совпадают с границами охранной зоны заповедника "Кузнецкий Алатау". Наиболее крупные реки, дренирующие месторождение, — Чексу и Тутуяс. Это притоки Томи, основной водной артерии, из которой снабжается питьевой водой и Междуреченск, и Новокузнецк, и Кемерово, и еще десятки населенных пунктов. Разрушат экосистемы Чексу и Тутуяса - иссякнет Томь.