Главные причины плохого качества воды в регионе кроются в износе сетей. В отдельных населённых пунктах он достигает 80-90 %, из-за чего ржавчина попадает в воду, а порывы приводят к вторичному загрязнению. Многие очистные сооружения устарели и не справляются с природными колебаниями состава воды, например, с ростом содержания марганца или железа. Финансирование выделяется точечно, в основном после громких жалоб или проверок, а комплексные программы модернизации требуют долгосрочных вложений, на которые местные бюджеты не всегда готовы идти. К тому же в подземных водах Кузбасса нередко повышено содержание железа и марганца, а вблизи крупных городов загрязнение источников может быть связано с деятельностью предприятий.